【作 者】：网站采编
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【摘 要】：文章目录 1 材料与方法 1.1 材料 1.2 方法 1.2.1 RNA的提取与反转录 1.2.2 烟草TCTP基因克隆 1.2.3 生物信息学分析 1.2.4 TCTP基因相对表达量 2 结果与分析 2.1 烟草TCTP扩增 2.2 烟草TCTP蛋白理化性质

文章目录

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

    1.2.1 RNA的提取与反转录

    1.2.2 烟草TCTP基因克隆

    1.2.3 生物信息学分析

    1.2.4 TCTP基因相对表达量

2 结果与分析

2.1 烟草TCTP扩增

2.2 烟草TCTP蛋白理化性质分析

2.3 烟草TCTP蛋白疏水性/亲水性

2.4 烟草TCTP蛋白翻译后修饰位点分析

    2.4.1 烟草TCTP蛋白磷酸化位点分析

    2.4.2 烟草TCTP蛋白糖基化位点分析

2.5 烟草TCTP蛋白二、三级结构分析与保守结构域分析

    2.5.1 烟草TCTP蛋白二、三级结构

    2.5.2 烟草TCTP蛋白保守结构域

2.6 烟草TCTP蛋白进化分析

2.7 “NC95”与“SY04-3”不同时期未接种与接种TCTP基因的表达分析

3 讨论与结论

文章摘要:翻译控制肿瘤蛋白（translational controlled tumor protein.TCTP）广泛分布在真核生物中,其表达在翻译和转录水平上受控制。近年来,在植物中对TCTP研究集中在植物生长与抗逆性方面。该试验以PVY高感品种"NC95"和高抗品种"SY04-3"为材料,克隆TCTP基因,并进行生物信息学以及相对表达量分析。结果表明:从"SY04-3"和"NC95"中分离出来的TCTP基因均包含507 bp的ORF,二者基因序列存在7处碱基突变,但均编码168个氨基酸,氨基酸序列存在1个区别。通过生物信息学分析显示,"SY04-3"和"NC95"分子量分别是18 782.16和18 773.06 kD,等电点分别是4.33和4.25。通过对氨基酸分析发现,TCTP蛋白为非跨膜亲水性蛋白,无信号肽,可能定位在细胞质,属于TCTP家族蛋白,"SY04-3"和"NC95"分别有13个和14个磷酸化位点,二者均有1个糖基化位点,进化分析显示与辣椒和茄子的亲缘关系最近。

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