文章摘要:由于不同基原和产地的党参有效成分差异较大，开发党参特异分子标记对于党参种质资源准确鉴定意义重大。该研究应用生物信息学软件PRIMER5.0、NTSYS-pc2.10e、POPGENE32，对小党参（Codonopsis minima）叶绿体基因组、秦岭党参（Codonopsis tsinlingensis）叶绿体和轮叶党参Codonopsis lanceolata线粒体序列进行SSR位点搜索，利用PRIMER5.0软件设计出120对SSR引物，筛选效果好且多态性高的16对cpSSR引物和10对mtSSR引物对20份党参材料进行种间通用性分析。结果显示，分别从基因组序列中搜索到66个cpSSR位点和26个mtSSR位点，其中小党参叶绿体中单核苷酸（86.20%）、二核苷酸（6.9%）、三核苷酸（6.9%）；秦岭党参叶绿体中单核苷酸（83.78%）、二核苷酸（13.51%）、三核苷酸（2.71%）；轮叶党参线粒体中单核苷酸（46.15%）、二核苷酸（53.85%）。PCR鉴定结果表明开发的26对SSR引物在党参属内具有很好的适用性。NTSYS-pc2.10e软件分析显示20份党参材料的遗传相似系数在0.38～1.00之间，在阈值0.69处分为两个亚群。运用POPGENE32软件对20份党参进行多样性分析并筛选出4对多态性引物，分析发现观测等位基因数（Na）共为12个，有效等位基因数（Ne）的范围为1.3629～2.6059个，各位点多态性位点百分率（PPL）均为100%，遗传学参数Ho、He、I的平均值分别为0.5558、0.4442、0.7532，说明各位点的多态性水平较高。以筛选出的4对引物对20份党参材料进行DNA指纹图谱绘制，发现DNA指纹图谱可将20份材料进行鉴别。该研究可为党参属种间的亲缘关系和种内遗传分化研究提供分子依据。

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